南投地檢署三年前成立「清境專案」，
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，透過內政部國土測繪中心和縣內地政單位，
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，實地偵查清境的166家民宿和農場，
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，已有14家民宿竊占國土被起訴，
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，其中10家民宿被依違反水土保持法判決有罪，
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，目前還有24家民宿在偵辦中。
檢察官偵辦時寬嚴並濟，若業者配合拆除竊占物，或取得合法使用權，大都獲得緩起訴處分，但要向檢察官指定的公益團體繳交緩起訴處分金。
若竊占國有土地的事實明確，又不配合拆除者，一律提起公訴，清境地區已有14家業者因竊占國土，被依違反水土保持法起訴，法院審理後，已有10家被判決有罪，並將竊占物沒收。
因清境地區的民宿家數很多，竊占國土的情況很普遍，不少民宿業者一開始心存觀望，心想「一百多家民宿，又都位在山區，檢察官即使有心調查，也很難每家都來調查」。因此，清境專案第一年，民宿業者都不相信這是玩真的，直到有民宿因竊占國土被起訴後，其他業者開始拆除竊占的露台或圍欄。
國有財產局和退輔會等主管機關，只要民宿業者主動還土地，大都和業者和解，不會窮追猛打。
地檢署針對清境地區的166家民宿、農場和住戶，使用的土地有無竊占國土，協調內政部國土測繪中心和埔里地政事務所，自100年開始，分四個階段逐一現場勘察和土地測量，目前第四階段還有24家民宿還在偵辦中。，