四位經濟系、農經系的系主任質疑示範區特別條例將會消滅本土農業，
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，要求刪除農業加值相關條文，
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，並要農委會主委陳保基下台負責。教授們更提出政府公開辯論政策，
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，希望政府一個月內回應。
農委會主委陳保基表示，
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，農委會歡迎各界提出建議，
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，各項議題都可以公開辯論，
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，但希望外界不要把目光全都集中在中國大陸的830項農產品，與台灣做生意的是全世界，並非僅有中國大陸。
陳保基表示，敏感性的、台灣有生產的大陸農產品，根本不可能開放進口，專案進口的部分，政府會嚴格審查，且至今也沒有人提出專案進口申請，過去有專案申請的是脫殼玉米、薏仁，是台灣根本沒有生產或者不夠用的產品。
陳保基說，自由經濟示範區面對的是全世界的競爭，是把農業加值，不是只有農產品加工，是把技術變成產業化，就像荷蘭一樣，台灣使用的原料來自全世界，並不是只有中國大陸。，