死囚器官移植除了有人權爭議，
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，實務上更有腦死判定的灰色地帶。台北榮總移植外科主任龍藉泉認為，
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，不如考慮讓死囚死後捐贈骨骼、眼角膜、皮膚，
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，也完成部分死囚遺愛人間贖罪的意願。亞東醫院院長朱樹勳表示，
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，死囚的腦死判定跟一般病人不同，
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，一般病人較嚴格，
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，國內應討論死囚腦死判定是否可有不同作法，
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，不要讓醫護人員為難，
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，摘取器官時感覺自己是「劊子手」。
一般腦死民眾捐贈器官前，需經過兩次腦死判定、兩次需間隔四小時，但死囚難經過這道程序。因此龍藉泉說，死囚捐器官有人權爭議，認為死刑犯沒有自由意志，腦死判定過程也不合法，可能在死刑犯還沒有真正腦死，就先摘取器官。
台大醫院加護病房主任柯文哲也說，刑法沒有腦的觀念，死刑犯執行槍決後，檢察官就已經簽署死亡證明，但醫療法規與刑事法規認定不同。正由於腦死判定有灰色地帶，龍藉泉說，非不得已榮總幾乎不移植死囚器官，幾年前重大罪犯陳進興伏法後捐出心臟，也是患者狀況緊急才破例移植。
他建議，不如讓死囚改捐骨骼、眼角膜、皮膚，一樣會有很多人受惠，既不減損死刑犯的遺愛人間的心意，且組織保存時間較長，不如內臟器官移植時間緊迫。以眼角膜來說，可在摘取後保存2到3天，有較長時間可以尋找合適的受贈者。，