康芮颱風造成中南部地區嚴重水患，
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，也引發地方災防中心開設時機、「八年八百億」治水計畫是否有效、以及是否續投入後續經費等爭議。經濟部和內政部今天下午至國民黨中常會報告救災檢討，
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，兩部雖都肯定「易淹水地區水患治理計畫」確實發揮成效，
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，但內政部報告也仍羅列此次受災較重的縣市災害應變中心開設時機。其中屏東縣、高雄市、台南市和雲林縣，
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，都是在中央災後應變中心第一次通報後才開設，
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，嘉義縣則是在第二次通報後才二級開設。
內政部長李鴻源在颱風後點名嘉義縣應變太慢，
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，引發地方反擊，
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，批評者並直指李發言有政治動機。由於李鴻源出國，內政部今天由次長蕭家淇在中常會上提出報告，報告也清楚交待各地方政府應變風災的情況。
內政部報告指出，中央災害應變中心是在8月28日下午5時第一次通報中南部各縣市立即成立災害應邊中心，當時南投、台中已經開設，但台南市、屏東縣、高雄市和雲林縣，分別在當天晚間6時、8 時、9時和10時才開設，其中高雄、台南是擴大三級開設，屏東、雲林則是二級開設。
嘉義縣並未在第一次通報後開設，中央災害應變中心當天晚上10時再度去電嘉義縣府，「立即成立災害應變中心」，嘉義縣府才在10時30分二級開設，成為各縣市開設時間「吊車尾」的縣市。
內政部報告也檢討各縣市雨水下水道設置情況，在災情較嚴重地區，基隆、雲林、嘉義、台南和高雄，最大雨量都高於設計時雨量；而台南和嘉義縣，雨水下水道實施率都不到6成，在台灣本島僅高於台東縣。
此外，康芮風災後，治水問題儼然成為另一場中央與地方大戰的導火線。內政部和經濟部在報告中都基本肯定「易淹水地區水患治理計畫」發揮效用，依照經濟部提供資料，18處重點整治計畫裡，有13處沒有嚴重災情，但包括雲林有才排水系統、嘉義市北排排水系統、高雄美濃排水系統，以及屏東東港溪、林邊溪排水系統等5處，仍發生淹水災情。
經濟部指出，在95年治理前，全國易淹水面積共達1150平方公里，治理後完成保護面積為500平方公里，尚未治理完成地區，共有約300平方公里在人口密集或重大建設地區，因此水利署建議再投入635億元，自103年到108年分6年辦理後續治理、維護管理計畫。，