會計法草率修法通過，
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，將特別費除罪範圍擴大至民代，
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，以及各大專院校職員、學術研究機構研究人員，
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，未將教授放入條文中，
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，可能引發「烏龍修法」的爭議。
上周五立法院通過的會計法第九十九條之一條文為，
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，中華民國一百零一年十二月卅一日以前各大專院校職員、學術研究機構研究人員支用政府機關補助之研究計畫費，其報支、經辦、核銷、支用及其他相關人員之財務責任均視為解除，不追究其行政及民事責任；如涉刑事責任者，不罰。但已報支不符法令之相關費用，應予繳回。
不過，會計法第九十九條之一當中的「各大專院校職員、學術研究機構研究人員」，並未將教授放入條文中。
民進黨團總召柯建銘表示，該法案版本當初是由國民黨提出、並送行政院修改定案；依通過的條文內容，「『其他相關人員』之財務責任」應該就可涵蓋教授部分，若無法涵蓋的話，因現在已是休會期，就必須由行政院提出覆議才能修改。
國民黨團書記長賴士葆昨深夜表示，他對此也有所保留，並未簽字；大黨鞭林鴻池當天不斷與他溝通，林鴻池說，不是為了顏清標，而是幾百個教授，其中還有比柯文哲更大咖的。首席副書記長林德福說，他沒有進去協商，他不知情。林鴻池則手機關機無法聯絡上。
參與立院協商的人士指出，上述條文明列「其他相關人員」，已涵蓋教師，所以並非疏漏，也不需要修正，但若行政部門認為不妥，可提覆議，但法案既已經立院三讀通過，則已產生效力，即回溯至適用日期者皆可除罪；而據指出，立法院通過的協商條文，事前行政部門已請兩批學者專家研修多時才提出。
【記者楊湘鈞／台北報導】行政院發言人鄭麗文昨晚表示，會計法修正案如有疑義，宜由立院於臨時會提復議，行政院尊重立院處理。
政院官員說，從整個修法過程來看，是由立委提案、朝野協商通過，幾無政院介入痕跡，要政院提覆議、冒倒閣風險，說不過去。，