李朝卿申請復職向行政院提請訴願案，
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，行政院訴願會10日公告決定書，
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，撤銷內政部4月22日所做不准李朝卿復職的決定，
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，由內政部在2個月內另為處分。
行政院訴願會雖認為內政部依公務員懲戒法的規定，
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，「情節重大者，
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，依法停職」，
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，但內政部於1年前予以停職的裁量基礎，
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，是否因法院審理的進行的程度而有所改變，
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，情節有無變更，如果有改變，有無繼續停職的正當性，是否違反平等原則而為差別處理，都有必要進一步查明。
行政院訴願會在決定書中，3問內政部，依公懲法須有「情節重大」，才能予以停職，但地方制度法規定，李朝卿1審未確定，已交保獲釋，依地方制度法「得准其先行復職」，為什麼捨地制法而就公懲法？內政部有必要再斟酌論述。
行政院訴願會也追問，內政部為何未讓李朝卿依行政程序法加以陳述。內政部陳純敬回應表示，因李朝卿在在多次陳情時，理由已說了很清楚，才沒讓李朝卿再做陳述。
內政部依公懲法不讓李朝卿復職的關鍵考量，主要是擔心一旦李朝卿復職，南投縣1級主管曾對李朝卿證詞不利者可能遭到報復，甚而影響法院的證詞與判決。，